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1．1反映不了实施国库集中支付制度和政府采购制度后出现的新业务 实施国库集中收付制度和政府采购制度后，财政资金不再由财政通过主管部门拔入用款单位，而是由财政部门从单一账户或采购专户按规定程序直接拨入职工工资账户或直接拨付给提供商品或服务的供应商，行政事业单位收到的财政资金不再表现为货币资金，而是一方面表现为收入的增加，另一方面表现为费用的增加(如工资支出等)或非货币性资产的增加（如存货、在建工程、固定资产等)，这就需要对行政单位和事业单位会计制度规定的核算内容进行相应的修改。同样，在财政总预算会计中，也要核算和反映这一资金流向的变化。此外，随着我国社会保障体系的不断完善，建立了养老、失业保险和医疗保险等相应的社会保障基金，这些基金由政府管理和运作，承担相应的受托责任，会计核算未能跟上新形势。 1.2不能为编制部门预算提供相关的会计信息 编制部门预算要求从基层单位逐级编制、层层汇总，克服了盲目性，使预算编制更加科学合理。目前，一些部门和单位的业务会计、基建会计还没有综合起来，依旧各有各的存款，各有各的账，各有各的报表，决算报表无法与年度预算进行对比分析。在现行事业单位会计制度中虽对资产负债表提出了编制汇总报表的要求，但对收入支出表并未明确此项要求。 1.3不能反映深化收支两条线后财政资金的运作方式和核算程序发生的变化 收支两条线改革后，在将预算外资金逐步纳入预算管理的同时，对各部门的预算外收入缴入财政专户:财政部门另按核定的综合定额标准，安排预算单位的年度财政支出，改变对某些部门收支挂钩的做法。对预算外资金收缴实行收缴分离办法就要求预算单位必须改变其过去对预算外资金所采用的留用、比例分成、上缴转拨等多种会计处理方式。但现行的预算会计制度不能反映深化收支两条线后财政资金的运作方式和核算程序所发生的变化。
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